CADD AIDD 分子动力学模拟

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专题一课程带您一步步实操学习蛋白结构分析、同源建模、虚拟筛选、分子对接（半柔性、柔性对接、蛋白-蛋白、蛋白-多肽、酶蛋白-配体、核酸-小分子、共价对接）、药效团模型、定量构效关系、碎片化药物设计、Gromacs 分子动力学模拟与结果分析，并以实例讲解与练习为主，达到即学即用效果，帮助学员系统掌握计算机辅助药物设计技术，助力学术研究；

专题二课程从AMBER程序入门学会编译方法，安装自己的AMBER可执行程序开始，依次讲授研究对象模型的获取与构建-体系预处理、能量优化、分子动力学模拟结果评估、结合自由能计算、相互作用机理分析、可视化、轨迹特征获取，并对经典文献进行复现。

专题三课程通过机器学习、深度学习的分类回归任务、分子特征、模型评估、参数优化与模型选择、浅层机器学习分类虚拟筛选、集成机器学习方法、DNN，GCN，GAT等主流深度学习模型实操以及结合相关课题的应用实践等内容，带您真正的进入人工智能药物发现的领域。

专题四课程从GROMACS程序入门学会编译方法，安装自己的GROMACS可执行程序开始，依次讲授生物体系简单到复杂的建模与TOP文件构建、常用模拟结果分析、水溶性蛋白质和配体作用分子动力学模拟过程及结果分析、生物膜磷脂双分子层生物膜、膜蛋白等建模分析、蛋白质结合自由能计算、药物分子开发溶剂筛选。

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